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專家構建黃麻基因組織特異表達數據庫

作者:楊澤茂

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日期:2020-11-26

  近日,中國農業科學院麻類研究所種質資源團隊在黃麻基因組織特異表達研究方面取得重要進展,通過比較轉錄組和基因網路共表達分析,充分挖掘在營養生長期和生殖生長期,黃麻根、莖皮、葉、花和果實中特異表達的基因和顯著相關的表達模塊,成功構建了黃麻基因組織表達數據庫,為黃麻功能基因挖掘奠定基礎。相關研究成果在線發表在《BMC基因組學(BMC Genomics)》和《工業作物和產品(Industrial Crops & Products)》上。

  據楊澤茂副研究員介紹,黃麻是世界上種植面積和產量最大的韌皮纖維作物。近年來,黃麻除了用作纖維,在藥用、食用、環保型材料等多用途利用方面的研究也不斷深入。黃麻基因組織表達數據庫的建立為改良黃麻各組織經濟價值提供了基因數據資源?;邳S麻基因組織表達數據庫,研究人員在莖皮中成功挖掘到一個控制纖維發育的調控網絡,該網絡由22個基因組成,其中一個轉錄因子起到核心調控作用。在花器官中,發現黃酮類合成代謝通路高度富集,多數基因表達上調。

  該研究得到中國農科院科技創新工程、國家自然科學基金及湖南省自然科學基金等項目資助。

  原文鏈接:

  (1)https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2020.112101

  (2)https://doi.org/10.1186/s12864-020-06805-6

黃麻基因共表達網絡

 莖皮中轉錄因子OMO55970.1調控的纖維發育相關基因網絡

黃麻花器官中黃酮類合成代謝通路和基因表達

所屬類別: 科研動態

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